1946年1月10日，國共雙方在重慶簽署了停戰(zhàn)協(xié)定，13日24時(shí)，遵照協(xié)議雙方停止了一切戰(zhàn)斗行動(dòng)。為了監(jiān)督停戰(zhàn)，調(diào)處在停戰(zhàn)中發(fā)生的沖突，14日，在北平成立了由國民黨政府代表鄭介民、共產(chǎn)黨代表葉劍英、美方代表羅伯遜及工作人員組成的軍調(diào)處執(zhí)行部。月底，由全國各黨派代表和無黨派代表38人參加召開的政治協(xié)商會議，通過了關(guān)于廢除一黨專政，實(shí)行民主改革，保衛(wèi)國內(nèi)和平等五項(xiàng)協(xié)議。同時(shí)還進(jìn)行了劃定停戰(zhàn)線，整編軍隊(duì)和改組政府等問題的談判，并達(dá)成了整軍方案。
中共中央華東局和新四軍兼山東軍區(qū)，堅(jiān)決遵照中共中央指示和中央軍委的部署，立即命令各地各部隊(duì)停止戰(zhàn)斗和破壞交通，就地堅(jiān)守陣地，集結(jié)整訓(xùn)，進(jìn)行和平停戰(zhàn)教育。2月15日，中共中央華東局發(fā)出了《百日練兵工作的指示》，進(jìn)行3個(gè)月的練兵運(yùn)動(dòng)。
蔣介石對實(shí)行政治改革，走和平建國的道路毫無誠意，而把停戰(zhàn)協(xié)議當(dāng)作準(zhǔn)備發(fā)動(dòng)內(nèi)戰(zhàn)和欺騙人民的外衣。1946年2月10日，派出特務(wù)搗毀在重慶校場口慶祝政協(xié)成立大會，打傷郭沫若、李公仆等愛國民主人士。鎮(zhèn)壓全國各地舉行的反內(nèi)戰(zhàn)群眾游行，秘密逮捕、暗殺進(jìn)步人士，制造了“南通慘案”。在軍事上進(jìn)一步調(diào)整指揮系統(tǒng)和兵力，在東北強(qiáng)占中長鐵路沿線的大中城市。在華東，成立了徐州靖綏公署和南通、濟(jì)南、賈汪三個(gè)綏靖司令部，將隴海路以南的15個(gè)軍整編為整編師，以完善內(nèi)戰(zhàn)作戰(zhàn)體制。同時(shí)利用地痞流氓、散兵游勇以及地主還鄉(xiāng)團(tuán)、保安隊(duì)，不斷向解放區(qū)騷擾和蠶食。
新四軍兼山東軍區(qū)和華東各地的黨政領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)，嚴(yán)格遵照中共中央的指示，從維護(hù)和平的大局出發(fā)，力避沖突，并對國民黨軍蓄意制造事端、破壞停戰(zhàn)協(xié)定的行動(dòng)進(jìn)行公開揭露和抗議。3月2日，軍事三人小組張治中、周恩來、馬歇爾來到華東地區(qū)作停戰(zhàn)后的實(shí)地考察。陳毅、黎玉、葉飛至濟(jì)南，向三人小組匯報(bào)山東各地國共沖突的情況，有理有據(jù)的揭露了國民黨大肆起用偽軍，通過鐵路運(yùn)兵向解放區(qū)進(jìn)攻的真相，接著陳毅陪同三人小組至徐州，聽取了粟裕、譚震林的匯報(bào)。
在軍事上，新四軍對國民黨軍和偽軍的蠶食進(jìn)攻，進(jìn)行堅(jiān)決的反擊。在華中地區(qū)，將部署在隴海路沿線的第六、第八、第九縱隊(duì)，南調(diào)至蘇中高郵、邵伯、海安一線和淮北靈璧地區(qū)，擔(dān)任南通至揚(yáng)州一線的防務(wù)和對徐州以南津浦路之警戒。為了迎擊國民黨軍可能對蘇中地區(qū)的大舉進(jìn)攻，中共中央華中分局和華中軍區(qū)，在蘇中地區(qū)積極進(jìn)行土地改革，并于4月底和5月上旬，對作戰(zhàn)部隊(duì)進(jìn)行擴(kuò)編。以第六縱隊(duì)與蘇中軍區(qū)獨(dú)立旅，在高郵地區(qū)擴(kuò)編為第六師，轄第十六、第十八兩個(gè)旅。在如皋地區(qū)擴(kuò)編為第一師，轄第一、第三兩個(gè)旅。以華中軍區(qū)第五軍分區(qū)4個(gè)團(tuán)和華中解放第四軍合編為第十縱隊(duì)。6月初，將在山東的第二縱隊(duì)第五旅調(diào)回淮南，與第六旅、獨(dú)立旅組成新的第二師兼淮南軍區(qū)。上述部隊(duì)編成后，華中軍區(qū)、華中野戰(zhàn)軍作戰(zhàn)部隊(duì)擴(kuò)大，擁有3個(gè)師、3個(gè)縱隊(duì)、7個(gè)旅共35個(gè)主力團(tuán)約5萬人，野戰(zhàn)作戰(zhàn)能力和機(jī)動(dòng)性有了提高，為粉碎國民黨軍對華中解放區(qū)的大舉進(jìn)攻創(chuàng)造了條件。
在山東地區(qū)，山東野戰(zhàn)軍于6月7日發(fā)起討逆戰(zhàn)役，攻克棗莊等據(jù)點(diǎn)30余處，控制膠濟(jì)鐵路200公里及津浦路濟(jì)南南北段400公里，大大改善了山東地區(qū)反對國民黨軍進(jìn)攻的戰(zhàn)略態(tài)勢。戰(zhàn)役期間，羅炳輝親赴棗莊前線，因過度勞累，在1946年6月21日返回臨沂軍部途中，突發(fā)腦溢血，在蘭陵逝世。
中共中央華東局、新四軍兼山東軍區(qū)，還組織解放區(qū)群眾開展生產(chǎn)和減租斗爭，貫徹中共中央《五四指示》，進(jìn)行土地改革，沒收地主的土地分給農(nóng)民，在農(nóng)村打倒封建勢力，使廣大農(nóng)民在政治上翻了身，在經(jīng)濟(jì)上得到土地，從而極大地調(diào)動(dòng)了農(nóng)民的積極性。廣大翻身農(nóng)民，為了保衛(wèi)土地、保衛(wèi)家園，踴躍參軍支前。